与季节性流感一样，人感染甲型H1N1流感的严重程度也各有不同，从轻微到严重不等。在2005年至2009年1月期间，美国发现过12起人感染甲型H1N1流感病例，未出现死亡病例。但是，甲型H1N1流感感染也会造成严重后果。1988年9月1日，威斯康星州一位身体一向健康的32岁孕妇在感染甲型H1N1流感后因肺炎住院接受治疗，但8天后死亡。1976年发生于新泽西州迪克斯堡的甲型H1N1流感暴发造成200多起病例，多人患上严重疾病，1人死亡。此次的甲型H1N1流感流行中，墨西哥18例确诊病例全部死亡。